有机硅导热灌封胶因环保、柔软、有弹性、化学性质很稳定，很少有溶剂能溶化，即使有溶解时，电路板也大受影响，所以只能用锋利的刀片慢慢进行分离。有一种是固化后比较软的有机硅灌封胶，如果要清除固化后的有机硅灌封胶只需用刀片在周围划个口，然后把固化的灌封胶取出来即可。
导热环氧灌封胶太过于坚硬，不太好清除，酒精、丙 酮、乙酸都没法完全清洗环氧树脂灌封胶。环氧树脂灌封胶在未固化变硬之前，可用酒精清洗掉，而变硬了的话酒精没法去除的，固化以后根本没法进行拆除，一旦元器件出现问题，只能直接破坏报废，所以，一开始在选择灌封胶的时候可以先考虑清楚这个问题，在后期应用中需不需要对产品进行拆除。
